谷歌 DeepMind 发布 AlphaGenome 2 基因序列模型:识别致病变异能力提升近一倍
IT之家 11 月 11 日消息,谷歌 DeepMind 发布新一代 DNA 序列模型 AlphaGenome 2 ,可预测 DNA 序列及其变异对特定人体细胞类型的影响,为科研人员挖掘疾病的细胞驱动因素提供全新工具。 人体每个细胞携带相同的 DNA 蓝图,但不同细胞类型会通过开关不同基因完成特定功能。全球的人类细胞图谱项目已对数百万细胞的基因表达进行绘制,但预测细微 DNA 变异如何影响细胞基因表达,仍是尚未解决的难题。 此前谷歌已推出初代 AlphaGenome ,可预测 DNA 变异对宽泛组织的分子活性影响,并推出了覆盖人类基因组全部 90 亿种单字母变异预测的 AlphaGenome Atlas ,助力罕见病、复杂性状与基础生物学研究。 AlphaGenome 2 从宽泛组织平均水平缩小至单个细胞类型与状态,并重构了模型架构,变异预测性能实现阶跃式提升,可捕捉宽泛组织模型中遗漏的疾病相关细胞中的变异效应,还能对模型未见过的细胞与疾病状态做出预测。 据IT之家了解,相比此前的最优模型,AlphaGenome 2 能识别出近两倍数量的、可改变细胞内基因表达的变异。该模型基于 68 类组织的超过 1 亿个单细胞图谱训练,将静态细胞图谱转化为人类遗传学的预测引擎。目前该模型已通过 AlphaGenome API 面向非商业研究开放,商业研究则处于私密预览阶段。 初代…
来源 ithome.com